التحديات التى يفرضها نظام الإدارة الأليكترونية للموارد البشرية:
1- إلغاء الحدود بين قسمى الموارد البشرية وتكنولوجيا المعلومات.
2- تحسين مكانة قسم الموارد البشرية.
3- تحويل تركيز قسم الموارد البشرية إلى العملاء.
4- حاجة العاملين بالموارد البشرية إلى فهم طبيعة عمل الشركة.
5- تأمين المعلومات.

عوامل أدت إلى نجاح العديد من الشركات فى تنفيذ هذا النظام:
العامل الأول : وضع استراتيجية لتنفيذ النظام.
العامل الثانى: إعداد دراسة حالة.
العامل الثالث: تحديد أفضل الخيارات المتاحة.